Det oplyser koncernen i en børsmeddelelse.
Fratrædelsen træder officielt i kraft fra 30. september næste år.
- Jeg er stolt af de resultater, vi har opnået som et team i mine år som koncernchef for DSV, siger Jens Bjørn Andersen i meddelelsen.
- Gennem store opkøb og integrationer har vi formået at støtte vores kunder, skabe værdi for vores aktionærer og - ikke mindst - at bringe bæredygtighed højere på dagsordenen.
- Jeg vil gerne takke bestyrelsen, mit lederteam og alle mine DSV-kolleger for deres tillid og støtte gennem årene, lyder det videre.
Den nuværende driftsdirektør, Jens H. Lund, overtager ansvaret som topchef, fremgår det af meddelelsen.
Bestyrelsen i DSV skriver i meddelelsen, at tidspunktet er det rette til at skifte direktør.
- Jens Bjørn Andersen har været medvirkende til at udvikle DSV til en førende global speditør med fremragende økonomiske resultater, siger bestyrelsesformand Thomas Plenborg.
- Det har været et privilegie at arbejde med Jens Bjørn, og på vegne af bestyrelsen vil jeg gerne takke ham for hans bidrag hen over årene.
Baggrunden for fratrædelsen beskrives ikke videre.
Det fremgår heller ikke, hvad den 57-årige topchef skal lave efter sin fratrædelse næste år.
Ikke desto mindre er han gået med til at forblive topchef indtil september for at sikre den bedst mulige overlevering.
Investorerne tager umiddelbart dårligt imod nyheden om fratrædelsen.
DSV-aktien falder mere end to procent godt en halv time efter børsåbning onsdag.
/ritzau/